Peňaženka EUDI bola vyvinutá tak, aby spĺňala vysoké požiadavky na bezpečnosť, ochranu údajov a dôveryhodnosť. Technické špecifikácie sa riadia zásadami “security by design” a “privacy by design”, takže aspekty bezpečnosti a ochrany údajov sa zohľadňujú už pri vývoji. Peňaženka EUDI využíva certifikované bezpečnostné mechanizmy a chránené oblasti moderných smartfónov na ochranu citlivých údajov a kryptografických kľúčov. Používatelia si zachovávajú kontrolu nad svojimi identifikačnými údajmi a sami rozhodujú o tom, ktoré informácie sa budú zdieľať s úradmi, spoločnosťami alebo inými organizáciami. Okrem toho peňaženka EUDI podporuje postupy šetrenia údajov, pri ktorých sa zverejňujú len tie informácie, ktoré sú skutočne potrebné. Cieľom je zabezpečiť bezpečné používanie digitálnych identít a zároveň čo najlepšie chrániť súkromie používateľov.